Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HhipQ7TN16 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HhipQ7TN16 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HhipQ7TN16 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HhipQ7TN16 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HhipQ7TN16 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HhipQ7TN16 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HhipQ7TN16 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HhipQ7TN16 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HhipQ7TN16 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms