Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shq1Q7TMX5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shq1Q7TMX5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms