Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ubfd1Q78JW9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ubfd1Q78JW9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ubfd1Q78JW9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ubfd1Q78JW9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ubfd1Q78JW9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ubfd1Q78JW9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ubfd1Q78JW9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ubfd1Q78JW9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ubfd1Q78JW9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ubfd1Q78JW9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubfd1Q78JW9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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