Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cspg5Q71M36 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cspg5Q71M36 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cspg5Q71M36 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cspg5Q71M36 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cspg5Q71M36 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cspg5Q71M36 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cspg5Q71M36 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cspg5Q71M36 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Cspg5Q71M36 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cspg5Q71M36 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cspg5Q71M36 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cspg5Q71M36 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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