Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Syne1Q6ZWR6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms