Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Topbp1Q6ZQF0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms