Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm3bQ6ZPY7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm3bQ6ZPY7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms