Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc44a1Q6X893 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc44a1Q6X893 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms