Protein–RNA interactions for Protein: Q6VNS1

Ntrk3, NT-3 growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntrk3Q6VNS1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms