Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc88cQ6VGS5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms