Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nudcd1Q6PIP5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms