Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad54bQ6PFE3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms