Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtifQ6PEE2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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