Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf1cQ6PDZ2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Taf1cQ6PDZ2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms