Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms