Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms