Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Zbtb40Q6PCS8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Zbtb40Q6PCS8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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Zbtb40Q6PCS8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Zbtb40Q6PCS8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Zbtb40Q6PCS8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbtb40Q6PCS8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms