Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms