Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd11Q6NS46 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd11Q6NS46 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms