Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc66Q6NS45 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc66Q6NS45 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms