Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms