Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cep78Q6IRU7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cep78Q6IRU7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms