Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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