Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms