Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms