Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smarca2Q6DIC0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms