Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Cep290Q6A078 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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