Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms