Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pdzrn3Q69ZS0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Pdzrn3Q69ZS0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Pdzrn3Q69ZS0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pdzrn3Q69ZS0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Pdzrn3Q69ZS0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pdzrn3Q69ZS0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pdzrn3Q69ZS0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pdzrn3Q69ZS0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pdzrn3Q69ZS0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pdzrn3Q69ZS0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pdzrn3Q69ZS0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pdzrn3Q69ZS0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pdzrn3Q69ZS0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Pdzrn3Q69ZS0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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