Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fgd6Q69ZL1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fgd6Q69ZL1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms