Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp4Q68FH0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pkp4Q68FH0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp4Q68FH0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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