Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg9aQ68FE2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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