Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Papd5Q68ED3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Papd5Q68ED3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms