Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpgs2Q66JT5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpgs2Q66JT5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms