Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc8eQ66JT1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc8eQ66JT1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms