Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usf2Q64705 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usf2Q64705 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usf2Q64705 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms