Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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PtprdQ64487 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprdQ64487 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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PtprdQ64487 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PtprdQ64487 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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PtprdQ64487 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprdQ64487 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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