Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gja3Q64448 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms