Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Abcg1Q64343 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Abcg1Q64343 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Abcg1Q64343 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Abcg1Q64343 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Abcg1Q64343 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Abcg1Q64343 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Abcg1Q64343 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Abcg1Q64343 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Abcg1Q64343 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Abcg1Q64343 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Abcg1Q64343 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Abcg1Q64343 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Abcg1Q64343 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Abcg1Q64343 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcg1Q64343 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.9 ms