Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Surf4Q64310 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Surf4Q64310 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Surf4Q64310 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Surf4Q64310 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms