Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ScxQ64124 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms