Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc18Q640L5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc18Q640L5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
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