Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Defa17Q64016 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Defa17Q64016 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Defa17Q64016 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Defa17Q64016 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Defa17Q64016 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Defa17Q64016 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Defa17Q64016 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Defa17Q64016 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa17Q64016 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Defa17Q64016 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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