Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lcn3Q62471 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lcn3Q62471 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms