Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Itga3Q62470 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itga3Q62470 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms