Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vil1Q62468 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vil1Q62468 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms