Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20865Q62460 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms