Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sh3gl2Q62420 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms