Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18Q62280 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Ss18Q62280 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ss18Q62280 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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