Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sall3Q62255 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sall3Q62255 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms